蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定方法包括X射線晶體學(xué)、核磁共振(NMR)和冷凍電子顯微鏡(cryo-EM)。X射線晶體學(xué)是利用X射線與蛋白質(zhì)晶體的相互作用來推斷蛋白質(zhì)的原子級結(jié)構(gòu),這種方法已經(jīng)成功解析了大量的蛋白質(zhì)三維結(jié)構(gòu),是目前主要的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定方法之一。然而,由于需要產(chǎn)生高質(zhì)量的蛋白質(zhì)晶體,這種方法在某些情況下可能具有限制。
核磁共振技術(shù)則利用原子核的磁性特性,通過測量核磁共振信號來推斷蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)信息。核磁共振可以在溶液狀態(tài)下測定蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu),因此對蛋白質(zhì)的自然狀態(tài)和動態(tài)變化有更好的解析能力。冷凍電子顯微鏡則是利用電子束與冷凍的蛋白質(zhì)樣品的相互作用,對蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行測定。由于不需要蛋白質(zhì)晶體,冷凍電子顯微鏡已經(jīng)被廣泛應(yīng)用于膜蛋白質(zhì)和大分子復(fù)合物的結(jié)構(gòu)測定。
常見問題:
Q1:蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定方法有哪些局限性?
A:每種蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定方法都有其局限性。X射線晶體學(xué)需要高質(zhì)量的蛋白質(zhì)晶體,對于難以結(jié)晶的蛋白質(zhì)可能不適用。核磁共振需要大量的同位素標(biāo)記樣品,對于大分子復(fù)合物可能存在測定困難。冷凍電子顯微鏡對樣品的制備和數(shù)據(jù)處理有較高的要求,對于小分子蛋白質(zhì)可能存在分辨率不足的問題。
Q2:為什么冷凍電子顯微鏡在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定中的應(yīng)用越來越廣泛?
A:冷凍電子顯微鏡不需要蛋白質(zhì)晶體,能夠直接觀察到蛋白質(zhì)在近自然狀態(tài)下的結(jié)構(gòu),并且能夠處理大分子復(fù)合物和膜蛋白質(zhì)等傳統(tǒng)方法難以處理的樣品。此外,隨著冷凍電子顯微鏡設(shè)備和數(shù)據(jù)處理技術(shù)的發(fā)展,其分辨率已經(jīng)可以接近原子級別,這使得冷凍電子顯微鏡在蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)測定中的應(yīng)用越來越廣泛。
特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析,N端測序,C端測序和全序列分析,以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的蛋白質(zhì),提供基于從頭測序法的蛋白質(zhì)從頭測序服務(wù),對蛋白序列進(jìn)行分析。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.采用目前世界上先進(jìn)的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達(dá) 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、蛋白質(zhì)組學(xué)
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;
2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法,適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;
3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;
4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;
5.專業(yè)生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。
三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細(xì)胞原理分離單個細(xì)胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細(xì)胞的原子質(zhì)量譜,最后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號分子表達(dá)量。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.技術(shù)先進(jìn),填補(bǔ)技術(shù)空白
采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭?xì)胞層面上對多種指標(biāo)同時進(jìn)行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。
2.分析數(shù)量大,成本較低
單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細(xì)胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。
3.應(yīng)用前景大
①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景;
②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;
③可檢測細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)
百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析,可從最小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。
六、基因敲除
百泰派克生物科技(BTP)采用優(yōu)化的CRISPR/Cas9系統(tǒng)為您提供高通量基因敲除服務(wù),包括病毒包裝、質(zhì)粒制備、Cas9濃度測試等,為您解決選擇哪個細(xì)胞進(jìn)行敲除、可不可以敲除、如何敲除以及敲除效率如何等關(guān)鍵問題??蛇M(jìn)行單/多基因敲除、移碼突變和大序列敲除。我們的人全基因組基因敲除陣列Array文庫覆蓋了完整的人類全基因組,全基因組陣列敲除庫已在人原代細(xì)胞全部完成高內(nèi)涵篩選的驗證,超過80%以上的靶點達(dá)到70%以上的敲除效率。
※服務(wù)優(yōu)勢:
1.樣本適用性強(qiáng)
適用于人、小鼠的細(xì)胞系,原代細(xì)胞,免疫細(xì)胞及iPS細(xì)胞等。
2.基因必要性及表達(dá)量分析
在進(jìn)行基因敲除實驗前,我們會基于生物信息學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)數(shù)據(jù)對不同細(xì)胞中基因必要性及表達(dá)量進(jìn)行分析,確保實驗的可行性,降低實驗風(fēng)險。
3.gRNA無需從頭設(shè)計和驗證
我們完成了人類全基因組gRNA的全部驗證,與藥物相關(guān)的靶點也完成了PCR測序驗證,無需針對客戶的靶點設(shè)計預(yù)實驗進(jìn)行g(shù)RNA驗證,大大縮短了項目周期。
4.高通量高效率
我們采用優(yōu)化的CRISPR/Cas9系統(tǒng)進(jìn)行高通量基因敲除,多個sgRNA/靶基因設(shè)計保證高敲除效率,超過80%靶點敲除效率在70%以上,短期內(nèi)(10天內(nèi))即可提供高敲除效率的KO pool,滿足絕大多數(shù)的應(yīng)用場景。
5.敲除效率雙驗證
基因敲除后,我們采用WB實驗中抗體KO驗證的首選方法——Sanger測序和深度蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)對敲除效率進(jìn)行雙驗證,數(shù)據(jù)真實性的雙重保障。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等專業(yè)服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。
1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,專業(yè)提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);
2.獲國家CNAS實驗室認(rèn)可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);
3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;
4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;
5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;
6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!
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蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定方法有由北京百泰派克生物科技有限公司為您提供,如您想了解更多關(guān)于蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的測定方法有
報價、型號、參數(shù)等信息,歡迎來電或留言咨詢。
注:該產(chǎn)品未在中華人民共和國食品藥品監(jiān)督管理部門申請醫(yī)療器械注冊和備案,不可用于臨床診斷或治療等相關(guān)用途。