百泰派克采用 QC 樣本譜圖比對(duì)和主成分分析兩種方法，項(xiàng)目實(shí)驗(yàn)中的 QC 樣本數(shù)據(jù)進(jìn)行分析評(píng)價(jià)。

主成分分析（ Principal Component Analysis, PCA） 是將原本鑒定到的所有代謝物重新線性組合，形成一組新的綜合變量，同時(shí)根據(jù)所分析的問(wèn)題從中選取2-3個(gè)綜合變量，使它們盡可能多地反映原有變量的信息，從而達(dá)到降維的目的。

不同于主成分分析（ PCA）法，Partial Least Squares Discrimination Analysis，(PLS-DA）或 Orthogonal PLS-DA，(OPLS-DA）是一種有監(jiān)督的判別分析統(tǒng)計(jì)方法。該方法運(yùn)用PLS-DA建立代謝物表達(dá)量與樣品類別之間的關(guān)系模型，來(lái)實(shí)現(xiàn)對(duì)樣品類別的預(yù)測(cè)。

在確保實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)的合理性和實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)的準(zhǔn)確性的基礎(chǔ)上，百泰派克首先對(duì)數(shù)據(jù)的完整性進(jìn)行檢查，對(duì)缺失值進(jìn)行刪除或者補(bǔ)充，刪除極值，并對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行樣本間和代謝物間的歸一化處理，以確保各樣本之間和代謝物之間可平行比較。

在進(jìn)行兩組樣本間的差異代謝物分析時(shí)，常用的單變量分析方法包括變異倍數(shù)分析（ Fold Change Analysis， FC Analysis）、T 檢驗(yàn)，以及綜合前兩種分析方法的火山圖（ Volcano Plot）。利用單變量分析可以直觀地顯示兩樣本間代謝物變化的顯著性，從而幫助我們篩選潛在的標(biāo)志代謝物（通常以 FC > 2.0 且 P value < 0.05 作為篩選標(biāo)準(zhǔn)）

為了評(píng)價(jià)候選代謝物的合理性，同時(shí)更全面直觀地顯示樣本之間的關(guān)系以及代謝物在不同樣本中的表達(dá)模式差異，我們利用定性的顯著性差異代謝物的表達(dá)量對(duì)各組樣本進(jìn)行層次聚類（Hierarchical Clustering），從而輔助我們準(zhǔn)確地篩選標(biāo)志代謝物，并對(duì)相關(guān)代謝過(guò)程的改變進(jìn)行研究。

百泰派克將得到的差異代謝物使用MBRole進(jìn)行代謝通路富集，使用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)做為背景，進(jìn)行相關(guān)通路分析。選取同物種的所有代謝物作為背景，分析 P value < 0.05的代謝通路。圖1和2為我們可提供的兩種代謝通路圖，富集的代謝通路以及相關(guān)T檢驗(yàn)分析結(jié)果會(huì)以表格的形式給出。

代謝組學(xué)研究中使用的高通量方法會(huì)產(chǎn)生大量代謝分析相關(guān)數(shù)據(jù), 這就需要采用生物信息學(xué)的方法進(jìn)行處理。百泰派克公司生物信息學(xué)分析人員能夠?qū)Υx組學(xué)數(shù)據(jù)知識(shí)進(jìn)行深度挖掘和全面分析，從質(zhì)譜原始數(shù)據(jù)出發(fā)，進(jìn)行峰對(duì)...

百泰派克的技術(shù)員們經(jīng)過(guò)多年的技術(shù)積累，采用ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）結(jié)合糖類及糖代謝途徑相關(guān)物質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品，配合糖類及糖代謝途徑相關(guān)物質(zhì)同位素標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行定量及定性分析

百泰派克公司建立了以NMR和ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）兩大平臺(tái)聯(lián)用，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類植物激素類物質(zhì)進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

基于Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了分別針對(duì)于植物初生代謝物和次生代謝物的代謝組學(xué)研究平臺(tái)，根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取植物初生代謝物和次生代謝物進(jìn)行分析，在有效回答您生物學(xué)問(wèn)題的同時(shí)提高了代謝物鑒定和定量數(shù)量和準(zhǔn)確性。

采用ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）結(jié)合肉堿及酰基肉堿類相關(guān)物質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品，配合肉堿及酰基肉堿類相關(guān)物質(zhì)同位素標(biāo)準(zhǔn)品進(jìn)行定量及定性分析

以GC/MS(7890A/5975C)和ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）兩大平臺(tái)聯(lián)用，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類動(dòng)物激素類物質(zhì)進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

百泰派克公司采用GC/MS(7890A/5975C)為主的檢測(cè)手段，配合各類脂肪酸同位素標(biāo)準(zhǔn)品，實(shí)現(xiàn)對(duì)超過(guò)~40 個(gè)脂肪酸進(jìn)行定量及定性分析，在顯著提高了定性定量的準(zhǔn)確性的同時(shí)大大提高了通量和穩(wěn)定性。

采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了針對(duì)于血清代謝組學(xué)研究平臺(tái)，根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取代謝物進(jìn)行分析

采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了針對(duì)于尿液代謝組學(xué)研究平臺(tái)，根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取代謝物進(jìn)行分析

采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了針對(duì)于體液代謝組學(xué)研究平臺(tái)，根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取代謝物進(jìn)行分析

百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）為基礎(chǔ)的ATP代謝相關(guān)小分子檢測(cè)平臺(tái)，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類ATP代謝相關(guān)小分子進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）為基礎(chǔ)的ATP代謝相關(guān)小分子檢測(cè)平臺(tái)，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類ATP代謝相關(guān)小分子進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

百泰派克公司建立了以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）為基礎(chǔ)的ATP代謝相關(guān)小分子檢測(cè)平臺(tái)，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類ATP代謝相關(guān)小分子進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

百泰派克公司采用GC/MS（Agilent 7890A/5975C）和LC/MS/MS（AB Sciex 5500）兩大平臺(tái)聯(lián)用。從而可實(shí)現(xiàn)對(duì)超過(guò)70種氨基酸及其衍生物進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

百泰派克采用Thermo公司的Q Exactive和AB公司的Q TOF 5600兩類質(zhì)譜儀建立了分別針對(duì)于微生物初生代謝物和次生代謝物的代謝組學(xué)研究平臺(tái)，根據(jù)您的實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟捎貌煌臉悠诽幚矸桨阜謩e高效提取微生物代謝物進(jìn)行分析

以GC/MS（Agilent 7890A/5975C）和ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）聯(lián)用為基礎(chǔ)的NAD代謝相關(guān)小分子檢測(cè)平臺(tái)，從而實(shí)現(xiàn)對(duì)多類NAD代謝相關(guān)小分子進(jìn)行定量及定性分析，其中涉及到的95%的物質(zhì)均使用標(biāo)準(zhǔn)品和同位素標(biāo)準(zhǔn)品定量。

以ACQUITY UPLC/TripleQuad5500（Waters/AB Sciex）為主的檢測(cè)手段，實(shí)現(xiàn)對(duì)多白藜蘆醇類物質(zhì)進(jìn)行定量及定性分析