CRISPR文庫
CRISPR/Cas9系統(tǒng)是當(dāng)今基因編輯領(lǐng)域最熱門的明星工具，2013年，Broad研究所的兩個研究團(tuán)隊分別在Science雜志同一期上發(fā)表了CRISPR文庫的相關(guān)研究。在此之后，基于CRISPR/Cas9的工具得到了快速發(fā)展，CRISPRa，CRISPRi及CRISPR敲除文庫已經(jīng)廣泛用于證明新的生物學(xué)機(jī)制，如耐藥性和細(xì)胞存活信號。多篇CNS(Cell、Nature、Science)連續(xù)報道。利用該技術(shù)，研究人員在藥物靶標(biāo)發(fā)現(xiàn)、基因功能研究、藥物敏感基因研究等領(lǐng)域取得了巨大的成功。
1. HYY現(xiàn)有CRISPR篩選文庫
文庫類型文庫簡介價格源lncRNA 激活庫
Human CRISPR lncRNA Activation Pooled Library (SAM-3)
靶向激活10,504個lncRNA
包含96,458個sgRNA靶點(diǎn)
咨詢?nèi)嗽辞贸龓?p>Human CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2)
靶向敲除19,050個mRNA 及1864個miRNA
包含123,411個sgRNA靶點(diǎn)
咨詢?nèi)嗽醇せ顜?p>Human CRISPR Activation Library (SAM-2)
靶向激活23,430個mRNA
包含70,290個sgRNA靶點(diǎn)
咨詢小鼠敲除庫
Mouse CRISPR Knockout Pooled Library (GeCKO v2)
?靶向敲除20,611個mRNA 及1175個miRNA
包含130,209個sgRNA靶點(diǎn)
咨詢小鼠激活庫
Mouse CRISPRa sgRNA library Caprano (P65-HSF)
靶向激活22,774 (Set A), 22,658 (Set B) 個mRNA
包含134,076個sgRNA靶點(diǎn)
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2. 全基因組CRISPR文庫有什么作用，能應(yīng)用于哪些方面，相對其他的有什么優(yōu)勢？
以全基因敲除文庫為例（GeCKO），GeCKO文庫是基于CRISPR-Cas9敲除技術(shù)，靶位點(diǎn)覆蓋全基因組的敲除庫。目前我們所擁有的是人類基因組CRISPR敲除文庫，其涵蓋了19050個靶基因，每個基因設(shè)計了6個靶位點(diǎn)（分為A，B兩個子文庫，每個子文庫各含3個靶位點(diǎn)），并涵蓋1864個miRNA，每個miRNA有4個靶位點(diǎn)，同時含有1000個空白對照sgRNA質(zhì)粒，共由123411個sgRNA靶標(biāo)質(zhì)粒組成。
可以將GeCKO文庫質(zhì)粒進(jìn)行病毒包裝，利用CRISPR敲除文庫病毒轉(zhuǎn)染目的細(xì)胞，可以獲得該目的細(xì)胞的全基因組敲除的細(xì)胞庫，根據(jù)不同的實(shí)驗(yàn)?zāi)康?，采用相?yīng)的篩選方式獲得存活下來的細(xì)胞，通過高通量測序，即可得到相應(yīng)的富集的sgRNA靶位點(diǎn)，篩選出相應(yīng)的功能缺失型基因。RNA干擾(RNAinterference,RNAi)文庫曾被廣泛應(yīng)用于功能缺失型基因篩選。利用RNA干擾鑒定高等生物基因功能的技術(shù)雖然已經(jīng)普及，甚至被應(yīng)用于高通量、全基因組規(guī)模的功能性篩選中，但是由于RNA干擾不能完全抑制基因表達(dá)，常常不足以造成穩(wěn)定的表型變化，從而影響對基因功能的正確判斷。另外，RNA干擾經(jīng)常伴隨脫靶現(xiàn)象，其基因回補(bǔ)驗(yàn)證的過程也非常繁瑣復(fù)雜，使用起來不盡如人意，因此必將逐步被CRISPR敲除文庫所取代。
CRISPR文庫價格
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