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針對基因的功能研究，通常會遇到兩種情況的問題：

一種情況是一個基因一個基因的進行，效率低，往往要做好幾個基因才能找到功能明顯和確定的基因。

另一種情況是做完高通量組學比如表達譜芯片、RNA-seq、全基因組測序、全外顯子測序、蛋白質組學等，有成百上千個候選基因、蛋白、突變位點等，不知道該挑選什么基因進行下面的研究。

HCS就是為了解決基因功能研究中這兩種最常見的困難而誕生的。

HCS（High content Screening）高內涵篩選，指一次性對至少20個甚至更多的編碼基因或非編碼RNA進行基因干擾、敲除或者過表達等基因操作；還可以一次性對大量的突變位點/SNP位點進行過表達，然后在細胞層面進行功能表型檢測，篩選有明顯功能的基因或者突變位點。可以大幅度縮短尋找新功能基因的科研時間，提高科研效率和節(jié)約科研成本。

技術條件

1. 全球領先的基因操作慢病毒文庫資源
shRNA-SET^TM慢病毒shRNA文庫
90000個RNA干擾慢病毒克隆，覆蓋超過22000個人類基因

cDNA--SET^TM全長基因克隆文庫

覆蓋超過20000個人類基因的ORF克隆

種類齊全的病毒工具（慢病毒、腺病毒、AAV）

2. 超過10年的應用經(jīng)驗，實驗人員技術熟練、經(jīng)驗豐富

3. 多種高內涵篩選儀器平臺

ThermoFisher Cellomics、Brooks Automation Celigo、YOKOGAWA CQ1

4. 高檢出率

5. 重復性好

HCS的多種應用案例

增殖功能基因篩選

調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后，通過高內涵儀器連續(xù)多天快速掃板，拍攝調控不同基因以后細胞的增殖情況，通過增殖曲線可以準備的判斷哪些基因knock-down或overexpression以后能夠導致細胞增殖能力的變化，篩選增殖相關的功能基因。

轉移相關功能基因篩選（劃痕法）

調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后，劃痕處理，通過高內涵儀器快速掃板，拍攝多個時間點劃痕愈合情況，觀察哪些基因上調或者下調以后能夠影響細胞的遷移功能，篩選轉移相關的功能基因

轉移相關功能基因篩選（transwell法）

調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后，根據(jù)感染后的細胞在一定時間內穿過transwell小室的細胞量，對細胞一定時間內的遷移率進行統(tǒng)計，通過shCtrl與各實驗組遷移率比較后進行統(tǒng)計，篩選轉移相關功能基因

明星基因功能回復panel

尋找目的基因或者是處理因素（如：藥物）相關的功能回復基因（目的基因或者是處理因素必須是抑制細胞增殖或者轉移的）。

在目的細胞中用shRNA包裝成慢病毒干擾目的基因，然后在目的基因干擾的情況下，感染下游明星通路基因的調控慢病毒，檢測細胞的增殖或者轉移情況，尋找跟目的基因有功能回復關系的明星通路基因。

藥靶基因篩選

調控不同基因的慢病毒感染目的細胞后，通過高內涵儀器連續(xù)多天快速掃板，拍攝調控不同基因以后細胞對藥物的敏感情況，通過計算不同基因操作以后，藥物對細胞的抑制率，初步篩選和藥物相關的目標基因。

血管新生功能基因篩選

調控不同基因的慢病毒感染腫瘤細胞一定時間后，將細胞上清轉移至人臍靜脈內皮細胞系培養(yǎng)孔中，通過HCS快速掃板，拍攝人臍靜脈內皮細胞的成管情況，可以快速的檢測上調，下調或者敲除不同基因的情況下，血管新生能力的變化，從而篩選到血管新生功能相關的功能基因。

服務內容

參考文獻

1.Microscopy-Based High-Content Screening . Cell163, December 3, 2015.

2.A Lentiviral RNAi Library for Human and Mouse Genes Applied to an Arrayed Viral High-Content Screen . Cell124, 1283–1298, March 24, 2006.

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6.Systematic Functional Annotation of Somatic Mutations in Cancer .Cancer Cell33, 450–462, March 12, 2018.Functional annotation of rare gene aberration drivers of pancreatic cancer. Nature communications; 7:10500; DOI: 10.1038; ncomms10500.

7.An RNAi screen of Rho signalling networks identifies RhoH as a regulator of Rac1 in prostate cancer cell migration. BMC Biology (2018) 16:29.

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9.High-content screening identifies kinase inhibitors that overcome venetoclax resistance in activated CLL cells. Blood, 18 August 2016; Volume 128, Number 7.

什么是 HCS？

HCS ，高內涵篩選，是 High Content Screening 的縮寫，是一次性對 20 甚至更多個編碼基因或非編碼 RNA 平行進行 RNAi 或過表達等基因操作，然后在細胞層面（in vitro）進行功能表型檢測，篩選有明顯功能的基因。完美解決做完基因芯片/二代測序/質譜后獲得成百數(shù)千個待研基因。

無從下手的問題。篩選量大，成本低，結果可靠，35 工作日出數(shù)據(jù)。

HCS 的多種應用案例

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注：該產(chǎn)品未在中華人民共和國食品藥品監(jiān)督管理部門申請醫(yī)療器械注冊和備案，不可用于臨床診斷或治療等相關用途