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質(zhì)粒純化的層析純化瓶頸,如何破局?

伯樂(lè)生命科學(xué)
2023.3.09

隨著細(xì)胞治理以及核酸疫苗的快速發(fā)展,除了最終成品的支持工藝,作為過(guò)程使用的多種原理的生產(chǎn)工藝也越來(lái)越受到重視,這些中間工藝的優(yōu)化對(duì)提高產(chǎn)品質(zhì)量和降低生產(chǎn)成本方面發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。

質(zhì)粒作為細(xì)胞治療和 mRNA 的前期原料一直其純化工藝就受到各種限制,其中可以進(jìn)行大規(guī)模下游生產(chǎn)的層析法更由于層析填料的特點(diǎn)限制了其純化效率。一般情況下,很多層析填料都是為蛋白質(zhì)純化設(shè)計(jì)的,內(nèi)部孔洞更小,不利于質(zhì)粒的內(nèi)部吸附;進(jìn)而導(dǎo)致有效的吸附表面非常少,降低了吸附效率。一般情況下,其吸附質(zhì)粒的效果低于吸附蛋白的50倍以上。(Ferreria,?et?al, 2000)

為了提高純化的質(zhì)量和效率,很多人開(kāi)始選擇大孔徑的復(fù)合模式填料。Aberin?和 Franklin 等人在 2002 年成功的報(bào)道了用 CHT?II 型(陶瓷羥基磷灰石)進(jìn)行一步法的質(zhì)粒純化,獲得了藥品級(jí)純度的產(chǎn)品。

Bio-Rad 研發(fā)部門(mén)采用 CHT II 20um 裝填到1ml 的層析柱中,然后對(duì)質(zhì)粒樣品 pS3(10Kb)pS5(9,48Kb)pUC19(2.6Kb)進(jìn)行了純化。

線性流速 311cm/hr

結(jié)合 Buffer:Na3PO4 10mM pH 7.0, EDTA 0.1mM

洗脫 Buffer:Na3PO4 0.4M pH 7.0, EDTA 0.1mM

動(dòng)態(tài)結(jié)合載量和產(chǎn)量和質(zhì)粒的類型有關(guān)。

對(duì)于不同的結(jié)合 Buffer,也會(huì)導(dǎo)致 CHTII 對(duì)質(zhì)粒的吸附。使用 20mM pH7.5 的磷酸鈉和 pH7.5 的硼酸溶液進(jìn)行測(cè)試,會(huì)發(fā)現(xiàn)硼酸緩沖液導(dǎo)致了 pUC19 的結(jié)合升高,但是 PS5 的下降。暗示較小的質(zhì)粒采用硼酸緩沖體系可能會(huì)對(duì)結(jié)合以及產(chǎn)量有幫助。

對(duì)于不同的結(jié)合 Buffer,也會(huì)導(dǎo)致 CHTII 對(duì)質(zhì)粒的吸附。使用 20mM pH7.5 的磷酸鈉和 pH7.5 的硼酸溶液進(jìn)行測(cè)試,會(huì)發(fā)現(xiàn)硼酸緩沖液導(dǎo)致了 pUC19 的結(jié)合升高,但是 PS5 的下降。暗示較小的質(zhì)粒采用硼酸緩沖體系可能會(huì)對(duì)結(jié)合以及產(chǎn)量有幫助。

在結(jié)合液中添加添加劑可以幫助提高結(jié)合效率,一般添加 NaCl 或 Ca2Cl。0.6M 的 NaCl 可以明顯的提高產(chǎn)量,Ca2Cl 在 5.5mM 的時(shí)候效率最高,但是過(guò)多的添加會(huì)形成渾濁的沉淀。

CHT 陶瓷羥基磷灰石具有很高的剛性,可以輕松的進(jìn)行規(guī)模放大。在質(zhì)粒純化工藝的優(yōu)化過(guò)程中,除了填料的選擇也和質(zhì)粒的二級(jí)結(jié)構(gòu),裂解液,離子特性有關(guān),因此具體的方案仍然需要在CHT上進(jìn)行優(yōu)化。但是優(yōu)化的工藝路線是明確的,最好的是在磷酸鹽的溶液中進(jìn)行,調(diào)整pH,NaCl或者Ca2Cl的濃度,實(shí)現(xiàn)雜質(zhì)和純凈質(zhì)粒的分離。

此外,CHT一步法的純化得到的質(zhì)粒產(chǎn)品可能會(huì)具有更多的優(yōu)勢(shì),因?yàn)镃HT可以對(duì)多種核酸以及內(nèi)毒素都有一定吸附能力,因?yàn)樵趦?yōu)化工藝的分離后,樣品中其宿主殘留的核酸或者內(nèi)毒素也能被消除。

引用文獻(xiàn)

·?Aberin?CS?and?Franklin?SG(2002),Plasmid?Purification?using?CHT?Ceramic?Hydroxyapatite Support. Bio-Rad Bulletin 2731

·?Ferreira GN et al.(2000).Downstream Processing of Plasmid DNA for gene?Therapy?and?DNA?Vaccine application.?Trends Biotechnology 18,380-388

* BIO-RAD是BIO-RAD LABORATORIES, INC. 在特定區(qū)域的商標(biāo)。

* 本產(chǎn)品僅用于科研用途,不用于臨床診斷。

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