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超實用工具 | 代謝組學MetaboAnalyst 5.0通路富集分析

麥特繪譜
2022.12.08

通過代謝組學篩選到差異代謝物后如何進行通路分析，代謝組學在線免費通路富集分析工具最新版MetaboAnalyst 5.0，登錄在線網(wǎng)址：https://www.metaboanalyst.ca/MetaboAnalyst/home.xhtml一站式完成。

Step. 1

登錄Home首頁

Step. 2

Step. 3

步驟3可根據(jù)篩選到的差異代謝物選擇Compound Name, KEGG ID, HMDB ID號，三選一即可，本流程以選擇輸入類型為化合物名稱(Compound Name)進行通路富集分析作示例，復制代謝物名稱到如下步驟4的空白處后

Step. 4

第1列物質名稱為黃色表示未被數(shù)據(jù)庫匹配的物質，詳細情況可

Step. 5

判定匹配的物質名稱前勾選上，并

Step. 6

全部黃色的物質View完畢后

Step. 7

下圖步驟9的Hypergeometric Test(超幾何分布)與Fisher''s Exact Test(費歇爾精確檢驗) 結果差距不大，此步通常默認參數(shù)即可；步驟10根據(jù)檢測樣品信息選擇相應物種的數(shù)據(jù)庫，以人Homo sapiens(KEGG) 示例下拉

Step. 8

Step. 9

如需生成TIFF或PDF等指定格式的通路富集分析圖請執(zhí)行步驟12和13操作，如對格式無特殊要求可忽略該步驟。

Step. 10

執(zhí)行下圖A-B-C操作

Step. 11

壓縮包結果文件說明

MetaboAnalyst 5.0作為代謝組學通用免費通路富集分析工具，深受代謝組學用戶認可，你學會了嗎？在使用中如有問題歡迎垂詢400-867-2686，與我們一起探討。

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