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聚乙二醇沉淀法純化質(zhì)粒DNA實驗

2019.3.26

這種方法最早由 Richaed Treisman ( 英國,倫敦,ICRF) 參照 Lis 的工作而設(shè)計。Lis 是最早用聚乙二醇(PEG ) 分離不同大小 DNA 的人。Treisman 法被廣泛用于堿裂解法制備的質(zhì)粒 DNA 的純化。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。


實驗方法原理這種方法最早由 Richaed Treisman ( 英國,倫敦,ICRF) 參照 Lis 的工作而設(shè)計。Lis 是最早用聚乙二醇(PEG ) 分離不同大小 DNA 的人。Treisman 法被廣泛用于堿裂解法制備的質(zhì)粒 DNA 的純化。
實驗材料

粗制質(zhì)粒

試劑、試劑盒

氯仿乙醇異丙醇LiClPEG-MgCI2氯仿乙酸鈉TE

儀器、耗材

Sorvall SS-34 或與其相當?shù)霓D(zhuǎn)頭冰水浴

實驗步驟

一、材料

1. 緩沖液和溶液

(1) 氯仿

(2) 乙醇

(3) 異丙醇

(4) LiCl ( 5 mol/L)

(5) PEG-MgCI2?溶液

(6) 酚:氯仿(1:1,V/V)

(7) 乙酸鈉(3 mol/L, pH 5.2 )

(8) TE ( pH 8.0 )

(9) TE ( pH 8.0)含 20 μg/ml RNase A

2. 核酸和寡核苷酸

粗制質(zhì)粒

3. 離心機和轉(zhuǎn)頭

Sorvall SS-34 或與其相當?shù)霓D(zhuǎn)頭

4. 專用設(shè)備

冰水浴

二、方法

1. 將 3 ml 粗制質(zhì)粒轉(zhuǎn)移到 15 ml Corex 管中,在冰浴中冷卻至 0℃。

2. 加入 3 ml 冰預(yù)冷的 5 mol/L LiCl,混勻,于 4℃ 離心 12000 g ( Sorvall SS-34 轉(zhuǎn)頭,10000 r/min ) 10 min。

3. 轉(zhuǎn)移上清至 30 ml Corex 管中,加等體積異丙醇,混勻,室溫離心回收核酸,12000 g ( Sorvall SS-34 轉(zhuǎn)頭,10000 r/min ) 10 min。

4. 小心倒去上清,倒置管口,使液體流干。室溫下用 70% 乙醇洗沉淀和管壁。小心將乙醇倒去,用真空抽吸器將管壁上殘留的乙醇抽干。在紙巾上倒置數(shù)分鐘,使無可見乙醇殘留。但應(yīng)使沉淀保持濕潤。

5. 用 500 μl 含 RNase A 的 TE ( pH8.0 ) 溶解濕潤的核酸沉淀。將溶液轉(zhuǎn)移到微量離心管,室溫放置 30 min。

6. 將質(zhì)粒-RNase 混合物用酚:氯仿抽提一次,然后用氯仿抽提一次。

7. 用標準的乙醇沉淀法回收 DNA。

8. 將質(zhì)粒 DNA 沉淀用 1 ml 滅菌水溶解,再加入 0.5 ml PEG-MgCl2?溶液。

9. 室溫放置超過 10 min,然后于室溫用微量離心機在最大速度離心 20 min, 以回收沉淀的質(zhì)粒 DNA。

10. 沉淀用 0.5 ml 70% 乙醇重懸以去除微量 PEG, 用微量離心機在最大速度離心 5 min 以回收核酸。

11. 吸去乙醇,重復(fù)步驟10。第二次洗滌后,在離心管架上放置 10~20 min, 使乙醇揮發(fā)。

12. 濕潤的質(zhì)粒沉淀用 500 μl TE ( pH 8.0 ) 溶解。以 1:100 用 TE ( pH8.0)稀釋后測 OD260?并計算質(zhì)粒 DNA 的濃度。按 1OD260?=50μg 質(zhì)粒 DNA/ml 計算。

13. 分裝 DNA 并保存于 -20℃。


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