實時熒光定量PCR的Ct值的相關介紹
Ct值(Cycle threshold,循環(huán)閾值)的含義為:每個反應管內的熒光信號到達設定閾值時所經歷的循環(huán)數(shù)
1. 熒光閾值(threshold)的設定
PCR反應的前15個循環(huán)的熒光信號作為熒光本底信號,熒光閾值的缺?。J)設置是3-15個循環(huán)的熒光信號的標準偏差的10倍,即:threshold = 10*SDcycle 3-15
2. Ct值與起始模板的關系
每個模板的Ct值與該模板的起始拷貝數(shù)的對數(shù)存在線性關系,公式如下。
Ct=-1/lg(1+Ex)*lgX0+lgN/lg(1+Ex)
n為擴增反應的循環(huán)次數(shù),X0為初始模板量,Ex為擴增效率,N為熒光擴增信號達到閾值強度時擴增產物的量。
起始拷貝數(shù)越多,Ct值越小。利用已知起始拷貝數(shù)的標準品可作出標準曲線,其中橫坐標代表起始拷貝數(shù)的對數(shù),縱坐標代Ct值。因此,只要獲得未知樣品的Ct值,即可從標準曲線上計算出該樣品的起始拷貝數(shù)。
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