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ASMS 新品速遞 | timsTOF Ultra 2 引領(lǐng)極微量樣本蛋白組學(xué)革命

2024.6.04

　　· timsTOF Ultra 2在對哺乳動物細胞、癌細胞系或組織活檢的4D-蛋白質(zhì)組學(xué)分析中鑒定深度和置信度大大提高；

　　·?timsTOF Ultra 2憑借其極致的靈敏度僅需25pg的蛋白樣本量，便能檢測出超過1000種蛋白質(zhì)，為外周血單核細胞（PBMCs）、小型免疫細胞、細菌細胞或亞細胞器蛋白質(zhì)組學(xué)和疾病生物學(xué)研究打開了新視角；

　　·?timsTOF Ultra 2在25pg的酶解樣品中鑒定和定量的蛋白數(shù)量增加50%，多肽數(shù)量增加高達100%（FDR卡值為1%）；

　　·?tims TOF Ultra 2對于樣本量較低的4D-蛋白質(zhì)組學(xué)應(yīng)用方向，能夠提升約40%的多肽和20%的蛋白質(zhì)鑒定；

　　·?先進的離子電荷控制（ICC 2.0）技術(shù)使得timsTOF Ultra 2適用于從超微量皮克到微克級別的寬上樣量范圍；

　　·?布魯克還推出了全新的top-down蛋白分析軟件OmniScape^TM，能夠從MALDI-ISD和LC-TIMS-MS/MS數(shù)據(jù)中自動、近乎完整地覆蓋蛋白質(zhì)序列；

　　·?Biognosys推出了具有優(yōu)化的AI功能Spectronaut^? 19 （SN19），進一步提升蛋白質(zhì)定量的深度和更高的肽段序列覆蓋度；

　　·?SN19目前針對timsTOF MS/MS數(shù)據(jù)進行了訓(xùn)練，能顯著提高4D-蛋白質(zhì)組學(xué)的分析性能；

　　·?PreOmics推出了高重復(fù)性且經(jīng)濟的深度血漿4D-蛋白質(zhì)組學(xué)ENRICHplus試劑盒，可在timsTOF HT質(zhì)譜上實現(xiàn)7倍的血漿蛋白鑒定深度提升；

　　·?全新4D-糖蛋白分析功能：glyco-PASEF^?采集模式和 GlycoScape^TM分析軟件；

　　·?布魯克現(xiàn)已向客戶發(fā)貨超過1000套timsTOF系統(tǒng)；

　　·?布魯克在2024年美國質(zhì)譜學(xué)會年會（ASMS）上推出三款質(zhì)譜儀，用于4D-蛋白質(zhì)組學(xué)、多組學(xué)組織成像以及高置信度應(yīng)用分析。

　　美國加利福尼亞州阿納海姆——2024年6月3日，在第72屆ASMS會議上，布魯克公司（納斯達克代碼：BRKR）推出了全新的超高靈敏度timsTOF Ultra 2質(zhì)譜儀，該系統(tǒng)大大提高了對微小細胞、亞細胞細胞器進行深度分析的靈敏度，并增加了樣本進樣量范圍的靈活性。結(jié)合新的Spectronaut^?? 19軟件和全新的PreOmics ENRICHplus試劑盒，布魯克正在建立從超高靈敏度到大規(guī)模深度血漿蛋白質(zhì)組學(xué)的4D-蛋白質(zhì)組學(xué)新標(biāo)準(zhǔn)。此外，布魯克還推出了OmniScape^TM軟件，用于完整蛋白的自上而下的序列確認和從頭測序分析。

　　布魯克全新timsTOF Ultra 2重新定義靈敏度

　　全新timsTOF Ultra 2擁有超高的靈敏度，僅需要25pg的蛋白消化液，即相當(dāng)于HeLa細胞蛋白量的1/10，鑒定和定量的蛋白數(shù)量增加50%，多肽數(shù)量增加高達100%。這使得timsTOF Ultra 2成為分析小型外周血單核細胞（PBMCs）低豐度蛋白質(zhì)的最佳選擇，或用于微生物群落中的細菌細胞，以及從生物活檢樣本中發(fā)現(xiàn)癌癥新抗原的免疫肽組學(xué)研究。

　　新的離子電荷控制（ICC2.0）軟件提供了從皮克到微克級別的樣本進樣量靈活性。

　　布魯克 ProteoScape? 軟件集成了Biognosys的Spectronaut 19（SN19）軟件，該軟件是DIA數(shù)據(jù)分析的金標(biāo)準(zhǔn)。全新的SN19改進了搜索引擎的AI功能和定量能力，并能夠精確預(yù)測分析物的碰撞截面積（DeepCCS）、保留時間（DeepiRT）和碎片離子強度（DeepFrag），從而平均增加13%的蛋白質(zhì)鑒定和提升定量準(zhǔn)確性。請參閱Biognosys新聞稿

　　PreOmics推出高可重現(xiàn)性、經(jīng)濟的ENRICHplus試劑盒結(jié)合久經(jīng)驗證的穩(wěn)定質(zhì)譜平臺timsTOF HT，建立深度血漿4D-蛋白質(zhì)組學(xué)解決方案

　　全新的單磁珠PreOmics ENRICHplus試劑盒結(jié)合timsTOF HT，可使血漿蛋白質(zhì)組獲得比純血高出7倍的蛋白鑒定和定量能力。隨著覆蓋深度的增加，加上timsTOF HT久經(jīng)考驗的高通量和穩(wěn)定性，使得大規(guī)模的深度血漿蛋白質(zhì)組學(xué)成為可能。請參閱PreOmics新聞稿

　　英國牛津大學(xué)蛋白質(zhì)組學(xué)設(shè)施發(fā)現(xiàn)部門負責(zé)人、副教授Roman Fischer博士表示：“timsTOF技術(shù)與ENRICHplus正在改變我們進行血漿蛋白質(zhì)組學(xué)研究的方式。在timsTOF Pro上，我們僅需使用 20 μL 的血漿，就能以每天60 個樣品的通量，實現(xiàn)平均每個樣品 3800 個蛋白質(zhì)的鑒定。我們以前從未在一次分析中達到過這樣的深度，現(xiàn)在我們可以檢測組織滲漏蛋白質(zhì)和其它低豐度的癌癥和神經(jīng)退行性疾病潛在生物標(biāo)志物。與強大的timsTOF系統(tǒng)結(jié)合，ENRICHplus正在為大規(guī)模深度、經(jīng)濟實惠的血漿蛋白質(zhì)組學(xué)帶來變革。”

　　布魯克推出OmniScape?自上而下的完整蛋白分析軟件

　　布魯克推出了OmniScape?，這是第一款自上而下的蛋白質(zhì)序列分析軟件，涵蓋了蛋白質(zhì)從頭測序和通過同源性搜索進行詳細蛋白質(zhì)變體的分析。

　　威斯康星大學(xué)麥迪遜分校的Boris Krichel博士總結(jié)道：“我對在非靶向自上而下蛋白質(zhì)組學(xué)中通過從頭序列分析來發(fā)現(xiàn)和注釋蛋白質(zhì)感到興奮。OmniScape?最令人印象深刻的功能是其基于不同的動態(tài)修飾類型自動匹配給出蛋白質(zhì)變體結(jié)果?！?/p>

　　OmniScape?支持來自LC-CCS-MS/MS的不同數(shù)據(jù)類型，例如可用于分析多種磷酸化蛋白質(zhì)。它整合不同數(shù)據(jù)集的結(jié)果得到非常高的序列覆蓋，提供可靠的序列確證和PTMs（翻譯后修飾）鑒定與區(qū)分。OmniScape?可以處理timsTOF fleX和MALDI-TOF質(zhì)譜儀（包括新款的neofleX）MALDI-ISD自上而下的譜圖，以及來自非布魯克儀器的數(shù)據(jù)，作為一種全面的自上而下的蛋白質(zhì)序列分析和異構(gòu)體解析的解決方案。

　　丹麥Novonesis高級科學(xué)經(jīng)理Christian Isak J?rgensen博士補充道：“OmniScape滿足了生物技術(shù)行業(yè)生產(chǎn)重組蛋白質(zhì)的真正需求。”

　　4D-糖蛋白組學(xué)的新型采集模式和計算分析能力

　　布魯克推出了第一款實時糖蛋白組學(xué)分析軟件——GlycoScape?。GlycoScape?是與拉德堡德大學(xué)醫(yī)學(xué)中心Hans Wessels博士領(lǐng)導(dǎo)的EnFORCE公-私合作項目合作開發(fā)^[1]，可以在采集數(shù)據(jù)時快速識別糖肽，無需依賴糖鏈庫，不僅可以識別以前未報告的糖鏈，還可以大大減少假陰性結(jié)果。GlycoScape?對糖蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)的無偏向性識別對于糖生物學(xué)在轉(zhuǎn)化和臨床研究中的進展至關(guān)重要，因為這些重要的研究領(lǐng)域在后基因組時代變得觸手可及。

　　荷蘭拉德堡德大學(xué)高級研究員Hans Wessels博士強調(diào)了其關(guān)鍵優(yōu)勢：“GlycoScape? 為timsTOF平臺的糖蛋白質(zhì)組質(zhì)譜數(shù)據(jù)的實時處理打開了大門，不再受限于糖鏈數(shù)據(jù)庫的限制?！?/p>

　　GlycoScape結(jié)合布魯克與烏得勒支大學(xué)Albert Heck教授團隊合作開發(fā)的具有選定目標(biāo)離子區(qū)域功能的新型glyco-PASEF采集方法，使用階梯能量碎裂前體離子，可以快速獲得超高靈敏度糖蛋白質(zhì)譜數(shù)據(jù)。

　　烏得勒支大學(xué)化學(xué)和藥物科學(xué)教授、荷蘭蛋白質(zhì)組學(xué)中心科學(xué)主任Albert Heck博士指出：“我們很高興能夠利用timsTOF平臺的獨特優(yōu)勢在糖蛋白組學(xué)領(lǐng)域取得開創(chuàng)性成果，現(xiàn)在我們已經(jīng)將這一技術(shù)轉(zhuǎn)化為glyco-PASEF方法進行糖生物學(xué)研究?！?/p>

　　[1] 該合作項目由Health~Holland頂級生命科學(xué)與健康部門授予的PPP（公私合作伙伴關(guān)系）津貼共同資助，旨在促進公私合作伙伴關(guān)系（資助編號：LSHM21032）。

　　關(guān)于布魯克公司——后基因組時代的新興領(lǐng)導(dǎo)者

　　布魯克（納斯達克：BRKR）致力于幫助科學(xué)家在后基因組領(lǐng)域取得突破性發(fā)現(xiàn)，并開發(fā)新的應(yīng)用，從而提高人類的生活質(zhì)量。布魯克的高性能科學(xué)儀器和高價值分析和診斷解決方案使科學(xué)家能夠在分子、細胞和微觀層面探索生命和材料。通過與客戶的密切合作，布魯克在后基因組生命科學(xué)分子和細胞生物學(xué)研究、應(yīng)用和制藥應(yīng)用、顯微鏡和納米分析以及工業(yè)應(yīng)用方面實現(xiàn)了創(chuàng)新，提高了生產(chǎn)力，幫助客戶取得成功。布魯克在臨床成像、臨床表型組學(xué)研究、蛋白質(zhì)組學(xué)和多組學(xué)、空間和單細胞生物學(xué)、功能結(jié)構(gòu)和凝聚態(tài)生物學(xué)，以及臨床微生物學(xué)和分子診斷領(lǐng)域提供差異化的高價值生命科學(xué)和診斷系統(tǒng)和解決方案。欲了解更多信息，請訪問www.bruker.com。

蛋白質(zhì)組學(xué)布魯克 ultra timstof

布魯克

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