畢式酵母表達常見問題及解析
1、問:我用畢式酵母表達一個27KD的蛋白,小量表達并做SDS-PAGE有一條類似三聚體的條帶。用大量表達,表達上清用鎳柱進行親和層析,在FPLC上可以看到一個大峰,但跑電泳卻沒有發(fā)現(xiàn)條帶,為什么呢?請賜教
參考見解:你在大量表達后有沒有跑電泳檢測?表達上清用鎳柱親和層析后洗脫液有沒有電泳檢測?你首先要做的是:1,確定你的蛋白確實有表達;2,親和層析是表達的蛋白確實被洗脫下來了.然后再考慮FPLC的事.
在FPLC上可以看到一個大峰,但跑電泳卻沒有發(fā)現(xiàn)條帶,可能的原因有:
1,上樣時沒有目的蛋白,可能是1)沒表達2)親和層析時沒洗脫或是穿透了;
2,目的蛋白結(jié)合在FPLC柱子上沒被洗脫;
3,目的蛋白穿透FPLC柱子,你在FPLC上看到的大峰可能是鹽分峰;
4,電泳時沒跑好,目的蛋白沒被檢測到.
FPLC大峰也可能是目的蛋白峰,它的吸收值有多少?不要看與基線相比的高度,要看吸收值,如果吸收值不高的話就是蛋白的濃度太低,濃縮后再跑電泳。
2、問:我現(xiàn)在做的是裂殖酵母表達,表達載體pesp-2,酵母菌珠sp-q01.說明只提供用化學(xué)轉(zhuǎn)化法,但我轉(zhuǎn)化了好幾次都沒有結(jié)果,是否也可以用電轉(zhuǎn)化,在多克隆位點把質(zhì)粒線性化?
參考見解:其實無論是那種類型的酵母表達,轉(zhuǎn)化方法基本是一制的。
化學(xué)轉(zhuǎn)化法對酵母轉(zhuǎn)化講就不是很高,這里你可以用電轉(zhuǎn)的。查一下以前別人的討論,看看電轉(zhuǎn)化方法,效率提高了,篩選的希望就大些了
由于篩選表達酵母的時間比較長,兩個方案同時做應(yīng)該來的及的
至于線性化,對于電轉(zhuǎn)是要做的步驟,這是為了后面定位重組整合。
3、問:我做畢赤酵母分泌表達,想問做陰性對照的是應(yīng)該用加甲醇前的上清還是用一直不加甲醇搖瓶同樣時間的上清呢?
參考見解:對于陰性對照我一般都用轉(zhuǎn)了不含基因的原始質(zhì)粒(比如9K等)的菌作為對照,誘導(dǎo)過程中同樣加入甲醇,誘導(dǎo)的時間均一樣,每次樣品都會有一個對照。
陽性對照可以用以前表達的比較穩(wěn)定的蛋白的工程菌充當(dāng)。
4、問:請教各位高人:我用G418篩轉(zhuǎn)化有多拷貝的細胞株,篩了兩次,四個梯度0.5mg/ml,1mg/ml,2mg/ml,4mg/ml.結(jié)果都沒長出細胞,空載體對照也沒長出。載體是pPIC9K。我用電轉(zhuǎn),涂于MD固體培養(yǎng)基,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)化效率較低,每塊板長出十幾個點,是否是轉(zhuǎn)化效率低導(dǎo)致的?謝謝指教!
參考見解:不知道你的轉(zhuǎn)化條件是否得到優(yōu)化?我認(rèn)為您是否可以從以下幾點入手:
(1)挑取酵母單菌落,接種至含有5ml YPD培養(yǎng)基的50ml三角瓶中,30℃、250~300r/min培養(yǎng)過夜;取100~500μl的培養(yǎng)物接種至含有500ml新鮮培養(yǎng)基的2L三角搖瓶中,28~30℃、250~300r/min培養(yǎng)過夜,至OD600達到1.3~1.5。
(2)電擊后馬上加入1ml冰預(yù)冷的1mol的山梨醇溶液將菌體混勻。
(3)推薦:電壓1.5kV;電容25μF;電阻200Ω。電擊時間為4~10msec。
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