全新的智能搜索引擎CHIMERYS?，是賽默飛與蛋白質(zhì)組學(xué)人工 智能領(lǐng)域的領(lǐng)導(dǎo)者MSAID?的合作成果，是全新一代為解析混合 譜而生的人工智能算法。這種革命性的算法可以大大提升DDA 數(shù)據(jù)中被識別的PSM數(shù)量，從而實(shí)現(xiàn)鑒定數(shù)目性能上的巨大飛 躍。CHIMERYS 基于 INFERYS 算法[1]構(gòu)建，其中 INFERYS 使用深 度學(xué)習(xí)模型預(yù)測肽段的 MS/MS 譜圖，CHIMERYS 進(jìn)一步嘗試解 釋 MS/MS 譜圖中的每一個(gè)峰。因此，可以有效進(jìn)行混合譜圖的解 析。 CHIMERYS搜索引擎目前可支持的工作流程包括肽段和蛋白的鑒 定、非標(biāo)記定量（LFQ）、TMT標(biāo)記定量，不僅可改善鑒定蛋白 質(zhì)的數(shù)量，還可提高定量性能。本文使用 Hela 標(biāo)準(zhǔn)肽段，在不同 分析梯度和樣品通量，包括8min到60min的5個(gè)不同梯度分別進(jìn)行 DDA數(shù)據(jù)采集，對比 SequestHT 和 CHIMERYS 搜庫結(jié)果，在不同 梯度下，CHIMERYS 均有不同程度的提升，其中梯度越短，譜圖 越復(fù)雜，提升比例越高，表明 CHIMERYS 適合復(fù)雜譜圖的解析。 在使用 CHIMERYS 后，180SPD通量可獲得原來 60SPD 使用 SequestHT時(shí)一致的蛋白和肽段鑒定，提示我們在后續(xù)使用CHIMERYS進(jìn)行數(shù)據(jù)解析可有效提高樣品分析通量。另外，本文中也對 CHIMERYS搜索結(jié)果的可信程度進(jìn)行了討論。