分子生物學常用名詞解釋
1、 分子生物學:是一門從分子水平研究生命現(xiàn)象、生命本質(zhì)、生命活動及其規(guī)律的科學。
2、 醫(yī)學分子生物學:是分子生物學的一個重要分支,又是一門新興交叉學科。它是從分子水平上研究人體在正常和疾病狀態(tài)下的生命活動及其規(guī)律,從分子水平開展人類疾病的預防、診斷和治療研究的一門科學。
3、酶工程:過去主要是通過生物化學方法從各種材料中提取、制備酶制劑?,F(xiàn)在主要應用基因工程技術制取酶制劑。
4、蛋白質(zhì)工程:過去主要是采用化學方法對純化的蛋白質(zhì)進行結(jié)構改造,制備出有特定功能的蛋白質(zhì)。現(xiàn)在主要應用基因工程技術,從改造目的基因的結(jié)構入手,在受體細胞中表達不同結(jié)構的蛋白質(zhì)。
5、微生物工程:又稱發(fā)酵工程是利用微生物特定性狀,使微生物產(chǎn)生有用物質(zhì)或直接用于工業(yè)化生產(chǎn)的技術。
6、DNA的甲基化:DNA的一級結(jié)構中,有一些堿基可以通過加上一個甲基而被修飾,稱為DNA的甲基化。
7、 CG島:在整個基因組中存在一些成簇、穩(wěn)定的非甲基化CG,這類CG稱為CG島。
8 、信使RNA:從DNA分子轉(zhuǎn)錄的RNA分子中,有一類可作為蛋白質(zhì)生物合成的模板,稱為信使RNA。
9、順反子:由結(jié)構基因轉(zhuǎn)錄生成的RNA序列亦稱為順反子。
10、 帽子結(jié)構:5端第1個核苷酸是甲基化鳥嘌呤核苷酸,它以5端三磷酸酯鍵與第2個核苷酸的5端相連,而不是通常的3、5磷酸二酯鍵。
11 、核酶:在沒有任何蛋白質(zhì)(酶)存在的條件下,某些RNA分子也能催化其自身或其它RNA分子進行化學反應,即某些RNA具有酶樣的催化活性,這類具有催化活力的RNA被命名為核酶。
12、 蛋白質(zhì)的變性:蛋白質(zhì)分子愛到物理化學因素(如加熱、紫外線、高壓、有機溶劑、酸、堿等)的影響時,可使維持空間結(jié)構的次級鍵斷裂,性質(zhì)改變,生物活性喪失,稱為蛋白質(zhì)的變性。
13、蛋白質(zhì)的復性:導致蛋白質(zhì)變性的因素除去后,某些蛋白質(zhì)又可重新回復天然構象,表現(xiàn)出天然蛋白質(zhì)的生物活性,稱為蛋白質(zhì)的復性。
14、 基因:是核酸分子中貯存遺傳信息的遺傳單位,是指貯存有功能的蛋白質(zhì)多肽鏈或RNA序列信息及表達這些信息所必需的全部核苷酸序列。
15、 基因組:細胞或生物體中,一套完整單倍體的遺傳物質(zhì)的總和稱為基因組。
16、 操縱子:是指數(shù)個功能上相關聯(lián)的結(jié)構基因串聯(lián)在一起,構成信息區(qū),連同其上游的調(diào)控區(qū)(包括啟動子和操縱基因)以及下游的轉(zhuǎn)錄終止信號所構成的基因表達單位,所轉(zhuǎn)錄的RNA為多順反子。
轉(zhuǎn)錄單位:儲存RNA和蛋白質(zhì)肽鏈序列信息的結(jié)構基因與指導轉(zhuǎn)錄起始部位的序列(啟動子)和轉(zhuǎn)錄終止的序列(終止子)共同組成轉(zhuǎn)錄單位。
17、 啟動子:是RNA聚合酶結(jié)合的區(qū)域,操縱基因?qū)嶋H上不是一個基因,而是一段能被特異阻遏蛋白識別和結(jié)合的DNA序列。
18、 質(zhì)粒:是細菌細胞內(nèi)攜帶的染色體外的DNA分子,是共價閉合的環(huán)狀DNA分子,能獨立進行復制。
19 、質(zhì)粒的不相容性:具有相同復制起始位點和分配區(qū)的兩種質(zhì)粒不能共存于一個宿主菌,這種現(xiàn)象稱為質(zhì)粒的不相容性。
20、 轉(zhuǎn)位因子:即可移動的基因成分,是指能夠在一個DNA分子內(nèi)部或兩個DNA分子之間移動的DNA片段。
20、自私DNA:核生物基因組中也存在一些可移動的遺傳因素,這些DNA順序并無明顯生物學功能,似乎為自己的目的而組織,故有自私DNA之稱。
21、 自殺基因:將某些細菌、病毒和真菌中特異性的基因轉(zhuǎn)導入腫瘤細胞,此基因編碼的特異性酶類能將原先對細胞無毒或毒性極低的前體物質(zhì)在腫瘤細胞內(nèi)代謝成毒性物質(zhì),達到殺死腫瘤的目的,這類前體轉(zhuǎn)移酶基因稱為自殺基因。
22 、斷裂基因:真核生物的結(jié)構基因是不連續(xù)的,編碼氨基酸的序列被非編碼序列所打斷,因而被稱為--在編碼序列之間的序列稱為內(nèi)含子,被分隔開的編碼序列稱為外顯子。
23、 順式調(diào)控元件(順式作用元件):是指那些與結(jié)構基因表達調(diào)控相關、能夠被基因調(diào)控蛋白特異性識別和結(jié)合的DNA序列。
24 、反式作用因子:一些蛋白質(zhì)因子可通過結(jié)合順式作用元件而調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄活性,這些蛋白質(zhì)因子稱為反式作用因子。
真核細胞內(nèi)含有大量的序列特異性的DNA結(jié)合蛋白,其中一些蛋白的主要功能是使基因開放或關閉,稱為反式作用因子,簡稱反式因子。
25、 啟動子:是RNA聚合酶特異性識別和結(jié)合的DNA序列。
26 、上游啟動子元件:是TATA盒上游的一些特定的DNA序列,反式作用因子可與這些元件結(jié)合,通過調(diào)節(jié)TATA因子與TATA盒的結(jié)合、RNA聚合酶與啟動子的結(jié)合及轉(zhuǎn)錄起始復合物的形成(轉(zhuǎn)達錄起始因子與RNA聚合酶結(jié)合)來調(diào)控基因的轉(zhuǎn)錄效率。
27 、反應元件:一些信息分子的受體被細胞外信息分子激活后,能與特異的DNA序列結(jié)合,調(diào)控基因的表達。這種特異的DNA序列實際上也是順式元件,由于能介導基因?qū)毎獾哪撤N信號產(chǎn)生反應,被稱為反應元件。
28 、增強子:是一段DNA序列,其中含有多個能被反式作用因子識別與結(jié)合的順式作用元件。
29、負增強子(沉默子);增強子內(nèi)含負調(diào)控序列。
30 、基因家族:指核苷酸序列或編碼產(chǎn)物的結(jié)構具有一定程度同源性的一組基因。
31、 基因超家族:是指一組由多基因家族及單基因組成的更大的基因家族。
32、 逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子:真核生物中一些中度重復序列的轉(zhuǎn)移成分則與一般細菌中的轉(zhuǎn)移成分不同,要先轉(zhuǎn)錄成RNA,再逆轉(zhuǎn)錄生成cDNA,然后重新整合到基因組中,這種逆轉(zhuǎn)錄旁路的轉(zhuǎn)移成分稱為逆轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子。
34 、反向重復順序:是指兩個順序相同的拷貝在DNA鏈上呈反向排列。其中一種形式是兩個拷貝反向串聯(lián)在一起,中間沒有間隔順序,這種結(jié)構亦稱回文結(jié)構。
35、 RFLP技術:通過限制酶酶切片段的長度多態(tài)性來揭示DNA堿基組成不同的技術稱為限制性片段長度多態(tài)性技術,簡稱RFLP技術。
36、 遺傳圖:又稱連鎖圖,是以具有遺傳多態(tài)性的遺傳標記作為“位標”遺傳學距離為“圖標”的基因組圖。
37、 物理圖:是以一段已知核苷酸序列的DNA片段為“位標”,以DNA實際長度(Mb或kb)作為圖距的基因組圖。
38、光修復:生物體內(nèi)有一種光復活酶,被光激活后能利用光反提供的能量使紫外線照射引起的嘧淀二聚體分開,恢復原來的兩個核苷酸,稱為光修復。
39、逆轉(zhuǎn)錄:是指以RNA為模板,利用宿主細胞中4種dNTP為原料,在引物的3端以5-3方向合成與RNA互補的DNA鏈的過程,此過程與中心法則方向相反,故稱為逆轉(zhuǎn)錄。 40、SD序列:AUG密碼子上游8~13個堿基處存在一個稱為SD序列的結(jié)構,該序列與小亞基中16SrRNA3端的序列互補,當mRNA與小亞基結(jié)合時,SD序列與16SrRNA3端互補序列配對結(jié)合,起始密碼準確的定位于翻譯起始部位。
41 、基因表達:是指生物基因組中結(jié)構基因所攜帶的遺傳信息經(jīng)過轉(zhuǎn)錄、翻譯等一系列過程,合成特定的蛋白質(zhì),進而發(fā)揮其特定的生物學功能和生物學效應的全過程。
42、基因工程:將基因進行克隆,并利用克隆的基因表達、制備特定的蛋白或多肽產(chǎn)物,或定向改造細胞乃至生物個體的特性所用的方法及相關的工作統(tǒng)稱為基因工程 43、分子克?。褐苽銬NA片段,并通過載體將其導入受體細胞,在受體細胞中復制、擴增,以獲得單一DNA分子的大量拷貝。
44、 DNA重組:不同來源的DNA分子可以通過末端共價連接(磷酸二酯鍵)而形成重新組合的DNA分子。
45、管家基因:有些在生命全過程都是必需的,且在一個生物個體的幾乎所有細胞中持續(xù)表達的基因,通常被稱為管家基因。 46、誘導表達:有些基因表達極易愛環(huán)境變化影響,在特定環(huán)境信號刺激下,有些基因的表達表面為開放或增強,則這種表達方式稱為誘導表達。
47、 嚴謹反應:細菌在缺乏氨基酸的環(huán)境中,RNA聚合酶活性降低,RNA(rRNA,tRNA)合成減少或停止,這種現(xiàn)象稱為嚴謹反應。 48、 衰減子:細菌中的mRNA轉(zhuǎn)錄和蛋白質(zhì)翻譯合成是偶聯(lián)在一起的。這一特點使細菌的一些操縱子的特殊序列可以在轉(zhuǎn)錄過程中控制轉(zhuǎn)錄水平。這些特殊序列稱為--又稱弱化子,位于一些操縱子中第一個結(jié)構基因之前,是一段能減弱轉(zhuǎn)錄作用于的順序。
49、組合式基因調(diào)控:每一種反式作用因子結(jié)合順式作用元件后雖然可發(fā)揮促進或抑制作用,但反式作用因子對基因表達的調(diào)控不是由單一因子完成的,而是幾種因子組合,發(fā)揮特定的作用,稱為組合式基因調(diào)控。 50、 細胞通訊:細胞間識別、聯(lián)絡和相互作用的過程稱為細胞通訊。
51、信號轉(zhuǎn)導:針對外源信號所發(fā)生的細胞應答反應全過程稱為信號轉(zhuǎn)導。 52、 調(diào)控結(jié)合元件:細胞內(nèi)的信號轉(zhuǎn)導分子有許多都是蛋白質(zhì),其分子中存在著一些特殊的結(jié)構域,它們是信號分子相互識別的部位,信號分子通過這些特殊結(jié)構域的識別和相互作用而有序銜接,形成不同的信號傳遞鏈或稱為信號轉(zhuǎn)導途徑,這些結(jié)構域稱為調(diào)控結(jié)合元件。
53、 第二信使:G蛋白活化之后唧 可激活其下游的效應分子,如腺苷酸環(huán)化酶和磷脂酶C等。這些效應分子隨后可催化一些分子的產(chǎn)生或濃度和分布的變化。這些小分子能夠繼續(xù)向下游傳遞信息,因而被稱為細胞內(nèi)小分子信使,亦稱為第二信使。已知的細胞內(nèi)小分子信使包括cAMP、cGMP、甘油二酯(DAG)、IP3和Ca2+等等。
54、 DNA重組:不同來源的DNA分子可以通過末端共價連接(磷酸二酯鍵)而形成重新組合的DNA分子,這一過程稱為DNA重組。
55、 限制酶:是一類內(nèi)切核酸酶,因而又稱為限制性內(nèi)切核酸酶。這類酶能識別雙鏈DNA內(nèi)部特異位點并且裂解磷酸二酯鍵。
56、 同功異源酶:來源不同的酶,但能識別和切割同一位點,這些酶稱為同功異源酶。
57、 同尾酶:有些限制酶識別序列不同,但是產(chǎn)生相同的粘性末端,這些酶為同尾酶。
58、 Klenow片段:用枯草桿菌蛋白酶可將DNA聚合酶I裂解為大小兩個片段,大片段的分子量為76kD,這個片段也稱為 Klenow片段。
59、 入 噬菌體:是感染細菌的病毒,其基因組是線性雙鏈DNA分子,當其感染宿主細胞并將基因整合到細胞后,基因組DNA變成環(huán)狀,用于分子克隆中的載體。
60、 基因文庫:采用限制酶將基因組DNA切成片段,每一DNA片段都與一個載體分子拼接成重組DNA,將所有的重組DNA分子都引入宿主細胞并進行擴增,得到分子克隆的混合體,這樣一個混合體稱為--
61、 cDNA文庫:將cDNA的混合體與載體進行連接,使每一個cDNA分子都與一個載體分子拼接成重組DNA。將所有的重組DNA分子都導入宿主細胞并進行擴增,得到分子克隆的混合體,這樣一個混合體稱為-
62、cDNA:是指體外用逆轉(zhuǎn)錄酶催化,以mRNA為模板合成的互補DNA。
63、轉(zhuǎn)化:是指將質(zhì)粒或其它外源DNA導入處于感受態(tài)的宿主細胞。并使其獲得新的表型 的過程。
64、 轉(zhuǎn)導:由噬菌體和細胞病毒介導的遺傳信息轉(zhuǎn)移過程也稱為轉(zhuǎn)導。
65、轉(zhuǎn)染:真核細胞主動攝取或被導入外源DNA片段而獲得新的表型的過程。
66、顯微注射法:在制備轉(zhuǎn)基因動物時,將外源基因通過毛細玻璃管,在顯微鏡下直接注射到受精卵的細胞核內(nèi),稱為顯微注射法。
67、 基因定點誘變:是指將基因的某一個或某些位點進行人工替換或刪除的過程。
68、 雙脫氧鏈終止法;是以單鏈或雙鏈DNA為模板,采用DNA引物引導新生DNA的合成,因此又稱為引物合成法,或酶促引物合成法。
69、核酸分子雜交:是指具有互補序列的兩條核酸單鏈在一定條件下按堿基配對原則形成雙鏈的過程。
70、探針:雜交體系中已知的核酸序列稱作探針。
71、DNA變性:在物理或化學因素作用下,例如加熱、酸堿或紫外線照射,可以導致兩條DNA鏈之間的氫鍵斷裂,而核酸分子中的所有共價鍵(如磷酸二酯鍵、糖苷鍵等)則不受影響,稱為DNA變性。常見方法:熱變性、堿變性、化學試劑變性。
72、DNA復性:當促使變性的因素解除后,兩條DNA鏈又可通過堿基互補配對結(jié)合形成DNA雙螺旋結(jié)構,稱DNA復性。
73、印跡:凝膠中的DNA片段雖然在堿變性過程中已經(jīng)變性成單鏈并已斷裂,轉(zhuǎn)移后,各個DNA片段在膜上的相對位置與在凝膠中的相對位置仍然一樣,因而稱為印跡。
74、Northern印跡雜交:將待測RNA樣品經(jīng)電泳分離后轉(zhuǎn)移到固相支持物上,然后與標記的核酸探針進行固-液相雜交,檢測RNA(主要是mRNA)的方法。
75、斑點印跡:將RNA或DNA變性后直接點樣于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,用于基因組中特定基因及其表達的定性及定量研究,稱斑點印跡。
76、原位雜交:核酸保持在細胞或組織切片中,經(jīng)適當方法處理細胞或組織后,將標記的核酸探針與細胞或組織中的核酸進行雜交,稱原位雜交。
77、液相雜交:待測核酸分子與核酸探針都存在于雜交液中,堿基互補的單鏈核酸分子在液體中配對形成雜交分子。目前常用的液相雜交的RNA酶保護分析法(RPA)、核酸酶S1保護分析法。
78、停滯效應:(平臺期):隨著目的DNA擴增產(chǎn)物的逐漸積累,酶的催化反應趨于飽和,此時DNA擴增產(chǎn)物的增加減慢,進入相對穩(wěn)定狀態(tài),即出現(xiàn)停滯效應。
79、筑巢PCR:先用一對外側(cè)引物擴增含目的基因的大片段,再用內(nèi)側(cè)引物以大片段為模板擴增獲取目的基因。
80、多重PCR:是在一次反應中加入多對引物,同時擴增一份DNA樣品中不同序列的PCR過程。
81、連接酶鏈反應(LCR連接酶擴增反應LAR):是以DNA連接酶將某一DNA鏈的5磷酸與另一相鄰鏈的3羥基連接為基礎的循環(huán)反應。
82、基因打靶:是指通過DNA定點同源重組,改變基因組中的某一特定基因,從而在生物活體內(nèi)研究此基因的功能。若定向敲除某個基因,稱為基因敲除,若定向?qū)⒁欢位蛐蛄刑娲硪欢位蛐蛄?,稱為基因敲入。
83、基因敲除:通過DNA同源重組,使得ES細胞特定的內(nèi)源基因被破壞而造成其功能喪失,然后通過ES細胞介導得到該基因喪失的小鼠模型的過程稱為--;其基本程序:(1)構建打靶載體;(2)ES細胞的體外培養(yǎng);(3)重組載體轉(zhuǎn)染ES細胞;(4)重組體轉(zhuǎn)染的ES細胞的鑒定;(5)ES細胞胚胎移植和嵌合體雜交育種。
84、打靶載體:由部分殘留的待敲除基因的同源片段、位于其內(nèi)部的neo基因和位于其外側(cè)的HSU-tk基因共同構成的載體即為打靶載體。
85、DNA芯片技術:指在固相支持物上原位合成寡核苷酸或者直接將大量DNA探針以顯微打印的方式有序地固化于支持物表面,然后與標記的樣品雜交,通過對雜交信號的檢測分析,即可得出樣品的遺傳信息。DNA芯片的類型:原位合成芯片和DNA微集陣列。
86、自發(fā)突變:引起DNA一級結(jié)構改變的原因主要有兩類:一類是復制時堿基的偶然性錯配,由此引起的突變稱為自發(fā)突變;另一類是體內(nèi)代謝過程中產(chǎn)生的自由基由某些環(huán)境因素引起的DNA一級結(jié)構改變,由此引起的突變稱為誘發(fā)突變。
87、 錯義突變:DNA分子中堿基對的取代,使得mRNA的某一密碼子發(fā)生變化,由它所編碼的氨基酸就變成另一種不同的氨基酸,使得多肽鏈中氨基酸的順序也相應地發(fā)生改變,這種突變稱--
88、同義突變:堿基取代,在蛋白質(zhì)水平上沒有引起變化,氨基酸沒有被取代,這是因為突變后的密碼子與原來的密碼子代表同一個氨基酸,這種突變稱為同義突變。
89、移碼突變:在編碼序列中,單個堿基數(shù)個堿基的缺失或插入以及片段的缺失或插入等均可使突變位點之后的三聯(lián)體密碼閱讀框發(fā)生改變,不能編碼原來的正常蛋白質(zhì),即所謂--
90、原癌基因:是一種正常細胞的正?;颍谡<毎芯幋a關鍵性調(diào)控蛋白,在細胞增殖和分化中起重要調(diào)控作用,它不具有致癌性,但當其受到物理、化學或病毒等致癌因素的作用而失控或發(fā)生突變時,可過度表達或持續(xù)表達其產(chǎn)物,就變成了癌基因,可以使細胞惡性轉(zhuǎn)化。
91、病毒癌基因:病毒所攜帶著的致轉(zhuǎn)化基因。
92、抑癌基因(抗癌基因):存在于正常細胞內(nèi)的一大類可抑制細胞生長并具有潛在抑癌作用的基因。其表達產(chǎn)物主要包括跨膜受體、胞質(zhì)調(diào)節(jié)因子或結(jié)構蛋白、轉(zhuǎn)錄因子和轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子、細胞周期因子、DNA損傷修復因子以及其它一些功能蛋白。
93、細胞周期素/周期依賴性激酶:有些蛋白激酶的細胞周期特異性或時相性激活依賴于一類呈細胞周期特異性或時相性表達、累積與分解的蛋白質(zhì),后者被稱為細胞周期素激酶,前者周期依賴性激酶。
94、啟動因子:在癌變的啟動階段使細胞發(fā)生癌前期改變的因素。
95、基因診斷:是以DNA和RNA為診斷材料,通過檢查基因的存在、缺陷或表達異常,對人體狀態(tài)和疾病作出診斷的方法和過程。
96、 基因治療:通過在特定靶細胞中表達該細胞本來不表達的基因,或采用特定方式關閉、抑制異常表達基因,達到治療疾病目的的治療方法。
97、 基因置換:(基因矯正):將特定的目的基因?qū)胩囟ǖ募毎ㄟ^定位重組,以導入的正常基因置換基因組內(nèi)原有的缺陷基因。
98、基因添加(基因增補)通過導入外源基因使靶細胞表達其本身不表達的基因。
99、基因干預:采用特定的方式抑制某個基因的表達,或者通過破壞某個基因而使之不能表達,以達到治療疾病的目的。
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